
Co-IP
- 蛋白質(zhì)復(fù)合物鑒定
- 蛋白質(zhì)相互作用
- 信號(hào)傳導(dǎo)研究
- 疾病機(jī)制解析
服務(wù)特色
Co-IP技術(shù)是研究蛋白質(zhì)相互作用的重要方法之一,通過對(duì)蛋白質(zhì)復(fù)合物的免疫沉淀和分析,可以揭示蛋白質(zhì)相互作用的組成和功能,為理解生物過程和疾病機(jī)制提供重要的信息。
服務(wù)介紹
免疫共沉淀技術(shù)(Co-Immunoprecipitation,Co-IP)是一種研究兩種蛋白在體內(nèi)是否存在相互作用的有效方法,通過抗體和已知蛋白結(jié)合,從而捕獲整個(gè)已知蛋白復(fù)合物,進(jìn)而研究復(fù)合物中與已知蛋白存在相互作用的蛋白。

服務(wù)優(yōu)勢(shì)
- 直接檢測(cè)蛋白質(zhì)與其他分子(如蛋白質(zhì)、DNA或RNA)之間的相互作用,提供了定性和定量信息。
- 可以在原生條件下進(jìn)行,更接近細(xì)胞內(nèi)環(huán)境,有助于揭示生物體內(nèi)的相互作用。
- 可以研究復(fù)雜的蛋白質(zhì)復(fù)合物,包括多個(gè)亞基或較大的蛋白質(zhì)復(fù)合物。
- 可以通過驗(yàn)證和功能研究進(jìn)一步驗(yàn)證相互作用的生物學(xué)功能。
服務(wù)流程
客戶提供
1、需檢測(cè)的樣品,一抗(也可以選擇由金開瑞提供)。
2、送樣要求:
? 離體后迅速超低溫處理并-80℃凍存的組織樣品,干冰運(yùn)輸;
? 組織:動(dòng)物組織不少于400 mg;植物組織不少于2 g;
? 細(xì)胞:2x10^7個(gè)細(xì)胞。
服務(wù)說明
| 服務(wù)名稱 | 服務(wù)內(nèi)容 | 交付內(nèi)容及標(biāo)準(zhǔn) | 服務(wù)周期(工作日) |
| 免疫共沉淀Co-IP | 蛋白提取 | 1 個(gè)樣本 | 16 |
| Co-IP前wb | 跑膠1個(gè)泳道 | ||
| Co-IP | 富集2次:IgG、IP各1次 | ||
| Co-IP后誘餌蛋白wb | 跑膠3個(gè)泳道:IgG、IP、input | ||
| SDS-PAGE銀染 | 跑膠3個(gè)泳道:IgG、IP、input | 4 | |
| 質(zhì)譜鑒定互作蛋白 | 質(zhì)譜鑒定:IgG、IP | 10-15 |
案例展示
常見問題與解析 (Q&A)
免疫沉淀(Immunoprecipitation,IP)是利用抗原抗體特異性反應(yīng)純化富集樣品中目的蛋白的一種方法。通常使目標(biāo)蛋白同抗體-protein A/G形成免疫復(fù)合物沉淀而得以收集,然后通過WB檢測(cè)目的蛋白。 免疫共沉淀(Co-Immunoprecipitation,CO-IP)是將樣品中同抗體靶蛋白相互作用的蛋白一同隨免疫復(fù)合物沉淀,可以檢測(cè)兩種目標(biāo)蛋白質(zhì)是否在體內(nèi)存在相互作用,也可以確定一種蛋白在體內(nèi)的相互作用蛋白。
coIP實(shí)驗(yàn)需要保證足夠的蛋白濃度才能維持原本存在的蛋白互作狀態(tài),尤其當(dāng)?shù)鞍棕S度較低、相互作用力不強(qiáng)、使用不易提蛋白組織等情況時(shí)。而且coIP的實(shí)驗(yàn)條件往往需要反復(fù)摸索。因此用于coIP實(shí)驗(yàn)需準(zhǔn)備細(xì)胞>2x10^7,動(dòng)物組織>500mg,植物組織>2g,并且須更加注意采集后速凍-80℃保存和避免反復(fù)凍融。
a.所使用的抗體不僅需要優(yōu)秀的親和力、特異性,其識(shí)別表位還可能被互作蛋白所掩蔽(主要是使用單抗時(shí)); b.當(dāng)?shù)鞍谆プ黜毎l(fā)生在特定生理代謝條件、組織細(xì)胞類型之中時(shí),coIP實(shí)驗(yàn)可能無法獲得互作結(jié)果; c.如果誘餌蛋白和或捕獲蛋白在樣本中豐度很低時(shí); d.兩個(gè)互作蛋白的親和力較弱; e.當(dāng)該蛋白互作需要較特定的離子強(qiáng)度,或者需要如Ca離子/Mg離子/ATP等輔因子時(shí),要?jiǎng)?chuàng)造合適的反應(yīng)條件會(huì)變得困難; f.一些樣品處理提取存在難度,提取足量目的蛋白與保持蛋白天然狀態(tài),需通過實(shí)驗(yàn)條件達(dá)到優(yōu)化平衡; g.外源表達(dá)的標(biāo)簽蛋白存在同內(nèi)源蛋白的位點(diǎn)競爭,這主要在使用標(biāo)簽抗體進(jìn)行實(shí)驗(yàn)時(shí)可能存在。
在coIP-WB鑒定結(jié)果中,IgG組無目的蛋白條帶、IP組有目的蛋白條帶,說明IP過程成功;銀染膠圖中,IP組相對(duì)于IgG組有更多蛋白條帶、且存在差異,說明coIP過程捕獲到互作蛋白;IP產(chǎn)物在質(zhì)譜檢測(cè)中鑒定到的蛋白數(shù)量不能作為判斷實(shí)驗(yàn)成敗的標(biāo)準(zhǔn),因?yàn)檫@取決于目的蛋白本身所具有的互作蛋白數(shù)量、結(jié)合力強(qiáng)弱等方面;IP產(chǎn)物的質(zhì)譜鑒定數(shù)量越多并不代表結(jié)果越好。
相關(guān)技術(shù)服務(wù)
| ? 雙熒光素酶報(bào)告系統(tǒng) | ? 酵母雙雜交 | ? EMSA |
| ? RNA pull-down | ? RIP-qPCR | ? DNA pull-down |
| ? ChIP-qPCR | ? 酵母單雜交 | ? CUT&Tag |
相關(guān)資源
1、Co-IP的實(shí)驗(yàn)步驟
● 細(xì)胞提取:從細(xì)胞或組織中提取蛋白質(zhì),可以使用細(xì)胞裂解緩沖液來破裂細(xì)胞膜,并添加蛋白酶抑制劑和磷酸酯酶抑制劑來保護(hù)蛋白質(zhì)的完整性。
● 抗體固定:將目標(biāo)蛋白質(zhì)的抗體與磁珠或瓊脂糖小球等固相材料結(jié)合,形成抗體固定的材料。
● 免疫沉淀:將細(xì)胞提取物與抗體固定的材料一起孵育,使目標(biāo)蛋白質(zhì)與其結(jié)合伙伴形成復(fù)合物。
● 洗滌:將反應(yīng)混合物進(jìn)行多次洗滌,以去除非特異性結(jié)合的蛋白質(zhì)和雜質(zhì)。
● 洗脫:通過改變pH、離子強(qiáng)度或添加競爭劑等方式,將復(fù)合物從抗體固定材料上洗脫下來。
● 蛋白質(zhì)分析:對(duì)洗脫的樣品進(jìn)行蛋白質(zhì)分析,可以使用SDS-PAGE和免疫印跡等技術(shù)檢測(cè)目標(biāo)蛋白質(zhì)及其結(jié)合伙伴的存在。
2、Co-IP的應(yīng)用場(chǎng)景
● 揭示蛋白質(zhì)復(fù)合物的組成和功能:Co-IP技術(shù)可以用于鑒定蛋白質(zhì)復(fù)合物的組成和結(jié)構(gòu)。通過選擇特定的目標(biāo)蛋白質(zhì)作為抗體的靶點(diǎn),可以將其與其他相互作用蛋白質(zhì)共沉淀,從而確定蛋白質(zhì)復(fù)合物的組成。這有助于理解蛋白質(zhì)復(fù)合物在細(xì)胞內(nèi)的功能、相互作用網(wǎng)絡(luò)和信號(hào)傳導(dǎo)通路。
● 研究信號(hào)傳導(dǎo)和基因調(diào)控:Co-IP技術(shù)可用于研究蛋白質(zhì)在信號(hào)傳導(dǎo)和基因調(diào)控中的相互作用。例如,可以通過共沉淀實(shí)驗(yàn)來確定轉(zhuǎn)錄因子與DNA序列的結(jié)合,并揭示基因調(diào)控的機(jī)制。此外,Co-IP還可用于研究蛋白質(zhì)激酶和底物之間的相互作用,從而了解細(xì)胞信號(hào)傳導(dǎo)通路的調(diào)控機(jī)制。
● 鑒定疾病相關(guān)的蛋白質(zhì)復(fù)合物:Co-IP技術(shù)可用于鑒定與疾病相關(guān)的蛋白質(zhì)復(fù)合物。通過將目標(biāo)蛋白質(zhì)與疾病相關(guān)的樣本共沉淀,可以發(fā)現(xiàn)與疾病發(fā)生和發(fā)展相關(guān)的蛋白質(zhì)相互作用。這有助于理解疾病的發(fā)病機(jī)制、尋找潛在的治療靶點(diǎn),并為藥物開發(fā)和治療策略提供重要的線索。
● 蛋白質(zhì)交互作用網(wǎng)絡(luò)分析:通過大規(guī)模的Co-IP實(shí)驗(yàn)和蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)結(jié)合,可以構(gòu)建蛋白質(zhì)交互作用網(wǎng)絡(luò)圖譜。這些網(wǎng)絡(luò)圖譜提供了蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)的全貌,有助于了解細(xì)胞內(nèi)蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)的結(jié)構(gòu)和功能。這對(duì)于研究細(xì)胞過程、生物學(xué)調(diào)控和疾病機(jī)制等具有重要的意義。
3、與Co-IP技術(shù)相關(guān)的常見問題與解答
(1) Co-IP實(shí)驗(yàn)中如何選擇合適的抗體?
? 選擇具有高親和力和特異性的抗體,最好是經(jīng)過驗(yàn)證的商業(yè)抗體或有良好文獻(xiàn)支持的自制抗體。
? 針對(duì)目標(biāo)蛋白質(zhì)選擇不同的克隆,進(jìn)行抗體特異性驗(yàn)證,如Western blotting。
? 進(jìn)行預(yù)實(shí)驗(yàn),評(píng)估抗體的適用性和效果。
(2) 如何優(yōu)化Co-IP實(shí)驗(yàn)條件以提高效率和特異性?
? 優(yōu)化提取和溶解條件,使用合適的緩沖液和洗滌液來提高蛋白質(zhì)的溶解和純化效率。
? 調(diào)整孵育時(shí)間和溫度,以優(yōu)化抗體與靶蛋白質(zhì)的結(jié)合。
? 增加洗滌步驟,以去除非特異性結(jié)合的蛋白質(zhì)。
? 使用阻斷劑,如牛血清蛋白(BSA)或魚精蛋白(Gelatin),減少非特異性結(jié)合。
(3) 如何解釋Co-IP實(shí)驗(yàn)結(jié)果中的負(fù)面數(shù)據(jù)或低信號(hào)?
? 檢查實(shí)驗(yàn)條件和步驟是否正確,如蛋白質(zhì)提取、溶解、抗體結(jié)合等。
? 評(píng)估抗體的質(zhì)量和特異性,進(jìn)行抗體驗(yàn)證實(shí)驗(yàn),如Western blotting。
? 重新評(píng)估目標(biāo)蛋白質(zhì)表達(dá)水平,確定其是否充分表達(dá)。
? 檢查Co-IP實(shí)驗(yàn)條件是否適當(dāng),可能需要調(diào)整抗體濃度、孵育時(shí)間等。



