為什么選擇金開瑞的DNA Pull-down技術(shù)服務(wù)
能夠高度特異地富集與目標(biāo)DNA序列相互作用的蛋白質(zhì),具有較低的背景干擾
可對(duì)DNA-蛋白質(zhì)相互作用進(jìn)行定量分析,測(cè)量結(jié)合的強(qiáng)度和親和力
可進(jìn)行高通量分析,同時(shí)研究多個(gè)DNA-蛋白質(zhì)相互作用
僅需要少量的樣本即可進(jìn)行實(shí)驗(yàn),適用于珍貴樣本的研究
DNA Pull-down是用于分析蛋白質(zhì)與DNA互作的一種分析技術(shù),是研究DNA-蛋白質(zhì)相互作用和調(diào)控的有力工具。
該技術(shù)首先需要針對(duì)待研究目的基因的調(diào)控區(qū)域設(shè)計(jì)并制備特異性探針;同時(shí),制備細(xì)胞核提取物;將探針和核提取物共同孵育,DNA結(jié)合蛋白就會(huì)和靶向序列特異性結(jié)合;然后,通過親和素磁珠純化蛋白質(zhì)DNA復(fù)合物;最后針對(duì)獲得的蛋白,使用WB驗(yàn)證或者質(zhì)譜方式鑒定蛋白質(zhì)類型。
DNA Pull-down技術(shù)有助于揭示基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)、信號(hào)傳導(dǎo)途徑和疾病機(jī)制等方面的重要信息。
我們承諾:若實(shí)驗(yàn)結(jié)果未達(dá)到合同要求,提供完善的售后服務(wù)
研究轉(zhuǎn)錄因子與DNA的結(jié)合
揭示基因表達(dá)調(diào)控機(jī)制
分析DNA損傷修復(fù)機(jī)制
探索染色質(zhì)結(jié)構(gòu)和功能
標(biāo)準(zhǔn)化流程確保實(shí)驗(yàn)結(jié)果準(zhǔn)確可靠
客戶提供DNA序列相關(guān)信息或DNA過表達(dá)質(zhì)粒
制備細(xì)胞核提取物,進(jìn)行樣品處理
設(shè)計(jì)并制備特異性探針,進(jìn)行標(biāo)記
將探針和核提取物共同孵育,使DNA結(jié)合蛋白與靶序列結(jié)合
通過親和素磁珠純化蛋白質(zhì)DNA復(fù)合物,進(jìn)行檢測(cè)或鑒定
提供完整的實(shí)驗(yàn)報(bào)告和數(shù)據(jù)
我們接受多種形式的樣品,確保實(shí)驗(yàn)順利進(jìn)行
完整的DNA Pull-down實(shí)驗(yàn)報(bào)告,包含所有實(shí)驗(yàn)步驟和結(jié)果分析
實(shí)驗(yàn)過程中的質(zhì)控?cái)?shù)據(jù)和報(bào)告,確保結(jié)果可靠
包含定制過程中所有原始數(shù)據(jù)、圖片及質(zhì)控報(bào)告,便于后續(xù)研究和發(fā)表
詳細(xì)的服務(wù)內(nèi)容、交付標(biāo)準(zhǔn)和周期說明
金開瑞提供全面的DNA Pull-down技術(shù)服務(wù),從樣品接收到最終結(jié)果交付,全程專業(yè)操作,確保實(shí)驗(yàn)結(jié)果的準(zhǔn)確性和可靠性。我們的服務(wù)涵蓋探針設(shè)計(jì)、樣品處理、實(shí)驗(yàn)操作和數(shù)據(jù)分析等各個(gè)環(huán)節(jié)。
| 服務(wù)名稱 | 服務(wù)內(nèi)容 | 交付內(nèi)容及標(biāo)準(zhǔn) | 服務(wù)周期(工作日) |
|---|---|---|---|
| DNA pull-down | 探針擴(kuò)增回收 | 擴(kuò)增2次 | 16 |
| 蛋白提取+考染 | 1個(gè)樣本 | ||
| pull down實(shí)驗(yàn) | 富集2次:IgG、IP各1次 | ||
| SDS-PAGE銀染 | 跑膠3個(gè)泳道:IgG、IP、input | 4 | |
| 質(zhì)譜鑒定互作蛋白 | 質(zhì)譜鑒定:IgG、IP | 10-15 |
眾多科研機(jī)構(gòu)選擇金開瑞的DNA Pull-down技術(shù)服務(wù)
銀染結(jié)果
WB驗(yàn)證
EMSA是用特定序列的標(biāo)記探針,同待驗(yàn)證蛋白孵育后進(jìn)行native-PAGE凝膠電泳,如果存在同探針結(jié)合的蛋白,則會(huì)出現(xiàn)電泳遷移率明顯低于自由探針的條帶出現(xiàn)。
DNA Pull-down是將探針結(jié)合在凝膠/磁珠上,以此收集同該DNA探針發(fā)生互作的蛋白。ChIP實(shí)驗(yàn)中所檢測(cè)的DNA-蛋白互作則發(fā)生在活組織細(xì)胞內(nèi)。
問題1:非特異性結(jié)合:蛋白質(zhì)可能與非特定的DNA序列結(jié)合,導(dǎo)致背景信號(hào)增加。
優(yōu)化建議:嘗試優(yōu)化DNA探針的設(shè)計(jì),選擇更特異的DNA序列作為探針,以增加結(jié)合的特異性。還可以通過引入競(jìng)爭(zhēng)性DNA或非特異性DNA序列來減少非特異性結(jié)合。
問題2:低信號(hào)強(qiáng)度:信號(hào)強(qiáng)度較弱,難以檢測(cè)目標(biāo)蛋白質(zhì)的結(jié)合。
優(yōu)化建議:優(yōu)化孵育條件,包括孵育時(shí)間、溫度和緩沖液的組成。調(diào)整孵育時(shí)間可能需要更長的孵育時(shí)間,以增加結(jié)合的效率。調(diào)整溫度可以根據(jù)蛋白質(zhì)的最佳結(jié)合溫度進(jìn)行優(yōu)化。此外,優(yōu)化緩沖液的組成,如添加劑或酶抑制劑,可以提高信號(hào)強(qiáng)度。
問題3:濃度依賴性:蛋白質(zhì)的結(jié)合可能與其濃度相關(guān),導(dǎo)致信號(hào)的變化不確定。
優(yōu)化建議:嘗試不同濃度的蛋白質(zhì)進(jìn)行實(shí)驗(yàn),確定最佳的濃度范圍,以獲得最強(qiáng)的信號(hào)。此外,可以使用標(biāo)準(zhǔn)品或內(nèi)部對(duì)照來定量分析,以校正信號(hào)的變化。
問題4:樣本純度不高:樣本中可能存在雜質(zhì)或其他干擾物質(zhì),影響目標(biāo)蛋白質(zhì)的結(jié)合。
優(yōu)化建議:優(yōu)化樣品處理步驟,如使用高純度的核酸提取方法,減少雜質(zhì)的存在。此外,可以使用特異性抗體進(jìn)行預(yù)處理,以去除非特定結(jié)合的蛋白質(zhì)。
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