
核酵母雙雜交點(diǎn)對(duì)點(diǎn)試劑盒
| 產(chǎn)品編號(hào) | 規(guī)格 | 數(shù)量 |
|---|---|---|
| JKR23012 |
實(shí)驗(yàn)原理
酵母核體系雙雜交技術(shù)是基于對(duì)真核細(xì)胞轉(zhuǎn)錄因子特別是酵母轉(zhuǎn)錄因子GAL4性質(zhì)的研究,GAL4包括兩個(gè)結(jié)構(gòu)域,即DNA結(jié)合結(jié)構(gòu)域(DNA-binding domain,BD)和轉(zhuǎn)錄激活結(jié)構(gòu)域(Activating domain,AD)。BD能夠識(shí)別位于GAL4效應(yīng)基因(GAL4-responsive gene)的上游激活序列(Upstream activating sequence,UAS)并與之結(jié)合,AD可以啟動(dòng)UAS下游的基因進(jìn)行轉(zhuǎn)錄。BD和AD分別單獨(dú)作用并不能激活轉(zhuǎn)錄,但是當(dāng)二者在空間上充分接近時(shí),則呈現(xiàn)完整的GAL4轉(zhuǎn)錄因子活性并可激活UAS下游啟動(dòng)子,轉(zhuǎn)錄啟動(dòng)子下游基因并使其表達(dá)。
Y2HGold菌株是GAL4系統(tǒng)酵母雙雜實(shí)驗(yàn)用菌株,可直接轉(zhuǎn)化質(zhì)粒進(jìn)行蛋白互作驗(yàn)證。Y2HGold-GAL4酵母雙雜系統(tǒng)需要兩種質(zhì)粒配套使用:pGBKT7和pGADT7。質(zhì)粒pGBKT7的篩選標(biāo)志為T(mén)RP1,用于表達(dá)BD(來(lái)自酵母轉(zhuǎn)錄因子GAL4 N端1~174位氨基酸)與目標(biāo)蛋白(Bait)的融合蛋白;質(zhì)粒pGADT7的篩選標(biāo)志為L(zhǎng)EU,用于表達(dá)AD(GAL4 C端768~881位氨基酸)與目標(biāo)蛋白(Prey)的融合蛋白。本試劑盒提供的產(chǎn)品包含了酵母雙雜驗(yàn)證過(guò)程中用到的各種培養(yǎng)基以及酵母轉(zhuǎn)化試劑,操作簡(jiǎn)單,能用于10對(duì)雙雜的互作驗(yàn)證(質(zhì)粒需自行擴(kuò)繁)。
產(chǎn)品優(yōu)勢(shì)
1.采用多個(gè)篩選步驟,可以減少非特異性相互作用的假陽(yáng)性結(jié)果。
2.每個(gè)環(huán)節(jié)均有嚴(yán)格的質(zhì)控,實(shí)驗(yàn)效率更高。
3.可處理復(fù)雜樣本,同時(shí)篩選和鑒定多個(gè)蛋白質(zhì)間的相互作用,實(shí)現(xiàn)高通量的篩選和分析。
4.使用操作簡(jiǎn)便,更易上手。
5.性?xún)r(jià)比高:試劑配套齊全,價(jià)格優(yōu)惠,低于市面上同款產(chǎn)品。
實(shí)驗(yàn)流程
結(jié)果展示
稀釋點(diǎn)種驗(yàn)證

1:Y2H[pGBKT7-A + pGADT7 ](自激活)
2:Y2H[pGBKT7-A + pGADT7-B ](實(shí)驗(yàn)組)
+:Y2H[pGBKT7-53 + pGADT7-T](陽(yáng)性對(duì)照組)
-:Y2H[pGBKT7-lam + pGADT7-T](陰性對(duì)照組)
常見(jiàn)問(wèn)題與解答
Ql:酵母雜交發(fā)生假陽(yáng)性的原因及解決方式?
產(chǎn)生原因:
(1)由于BD融合誘餌蛋白有單獨(dú)激活作用,或者其激活作用被外來(lái)蛋白激活。
(2)AD融合靶蛋白如果有DNA的特異性結(jié)合,也可以單獨(dú)激活報(bào)告基因的表達(dá)。
(3)BD和AD在文庫(kù)中會(huì)有隨機(jī)碰撞導(dǎo)致空間上的接近,以致下游報(bào)告基因的表達(dá)。
解決方法:
(1)對(duì)于點(diǎn)對(duì)點(diǎn)驗(yàn)證來(lái)說(shuō),可同時(shí)將誘餌和獵物進(jìn)行自激活驗(yàn)證,減少假陽(yáng)性的判定,但是一旦誘餌和獵物均產(chǎn)生自激活,后續(xù)自激活的處理方式(截短)會(huì)浪費(fèi)較多的時(shí)間;
(2)由于每個(gè)報(bào)告基因上游的調(diào)控區(qū)各不相同,因此用不同的報(bào)告基因驗(yàn)證陽(yáng)性,可用于排除或減少假陽(yáng)性,這也是我們主要采取的方式;
(3)單雜啟動(dòng)子,我們主要采用將報(bào)告基因整合到酵母的染色體上,可以使基因表達(dá)水平穩(wěn)定,消除了由于質(zhì)粒拷貝數(shù)變化引起的基因表達(dá)水平的波動(dòng)而造成的假陽(yáng)性。
Q2:如果誘餌可以直接激活報(bào)告基因,該如何處理?
為保證誘餌蛋白功能的完整性,首先我們會(huì)考慮用3’AT/ABA進(jìn)行背景抑制,但是由于這兩種試劑對(duì)酵母生長(zhǎng)具有較大的毒性,后續(xù)可能會(huì)影響文庫(kù)篩選,因此在3'AT超過(guò)15mM,ABA超過(guò)1200ng/mL時(shí)我們會(huì)考慮將誘餌蛋白進(jìn)行截?cái)啵ㄟ^(guò)查閱文獻(xiàn)和相關(guān)數(shù)據(jù)庫(kù),截去轉(zhuǎn)錄激活的區(qū)域,但是需要注意的是,截去的這一部分很有可能會(huì)影響到互作結(jié)果。
Q3:如何從驗(yàn)證結(jié)果判斷兩個(gè)蛋白是否互作及互作強(qiáng)度?
酵母核雙雜點(diǎn)對(duì)點(diǎn)驗(yàn)證是根據(jù)是否激活3個(gè)報(bào)告基因(MELI、HIS、Ade2)來(lái)反推是否有互作,是否激活了報(bào)告基因又是根據(jù)涂布相應(yīng)平板的顏色反應(yīng)及菌落有無(wú)及大小來(lái)判斷,因此我們可以直接根據(jù)顯藍(lán)的強(qiáng)弱、TDO上斑的多少以及大小、QDO上是否能生長(zhǎng)來(lái)初步判斷互作的強(qiáng)弱。
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